В правила внутреннего распорядка завода элара были внесены изменения согласно которым работники с 1 марта 2015 года должна Премироваться

Добрый день! Считаю, что в данном случае верной является позиция работодателя  

В соответствии со ст. 129 ТК РФ заработная плата (оплата труда работника) — вознаграждение за труд в зависимости от квалификации работника, сложности, количества, качества и условий выполняемой работы, а также компенсационные выплаты (доплаты и надбавки компенсационного характера, в том числе за работу в условиях, отклоняющихся от нормальных, работу в особых климатических условиях и на территориях, подвергшихся радиоактивному загрязнению, и иные выплаты компенсационного характера) и стимулирующие выплаты (доплаты и надбавки стимулирующего характера, премии и иные поощрительные выплаты).

Согласно ст. 12 Трудового кодекса РФ 

Локальный нормативный акт вступает в силу со дня его принятия работодателем либо со дня, указанного в этом локальном нормативном акте,и применяется к отношениям, возникшим после введения его в действие. В отношениях, возникших до введения в действие локального нормативного акта, указанный акт применяется к правам и обязанностям, возникшим после введения его в действие.

Слесарь шишкин работающий на данном предприятии с 2009 года потребовал за весь период с заявлением о выплате ему премии

В данном случае за прошедший период с 2009 г. Шишкин получал зарплату и премии согласно действующему трудовому договору и условиям локальных актов данного работодателя (например положение об оплате труда и т.д. и.т п.)