Добрый день, Андрей!
Пропишите в договоре порядок оплаты квартиры: какую часть Вам передает покупатель в день подписания договора, какую часть и в какой срок обязуется передать в будущем. А также установите в договоре купли-продажи, что в Вашу пользу (продавца) возникает ипотека в силу закона. Таким образом, квартира будет обременена залогом. В случае возникновения спора, Вы сможете легко доказать, что часть денег не оплачена и требовать обращения взыскания на предмет залога.
После того, как продавец с Вами окончательно рассчитается, обременение снимается по Вашему совместному заявлению (продавца и покупателя) в Росреестре.
Если Вам помогла эта консультация, пожалуйста, оцените ее. Спасибо.