Если я уже сейчас подам рапорт на увольнение КЧ обязан его рассмотреть, но что он на нем должен написать?

Какую резолюцию поставит командир части?

Прежде всего, до подачи рапорта поговорите с КЧ, какие его действия в части дальнейшего прохождения вами военной службы. 

Основания увольнения с военной службы указываются в ст. 51 Федеральный закон от 28.03.1998 N 53-ФЗ.

В случае сокращения занимаемой воинской должности и при невозможности назначения военнослужащего, проходящего военную службу по контракту, на равную воинскую должность и отсутствии его согласия с назначением на высшую или низшую воинскую должность такой военнослужащий может быть досрочно уволен с военной службы в связи с организационно-штатными мероприятиями (подпункт «а» пункта 2 статьи 51 Федерального закона «О воинской обязанности и военной службе»).
По смыслу нормативных положений, регулирующих военную службу и порядок ее прохождения, при сокращении воинской должности, занимаемой военнослужащим, и отсутствии вакантных воинских должностей в военном округе, в котором он проходит военную службу, другая воинская должность должна предлагаться военнослужащему, изъявившему желание на назначение на низшие или высшие воинские должности, в масштабе Вооруженных Сил Российской Федерации, а военнослужащим других войск, воинских формирований и органов — в масштабах федерального органа исполнительной власти, в котором они проходят военную службу ( п. 40 Постановления Пленума Верховного Суда РФ от 29.05.2014 N 8).