Здравствуйте!
По всем вопросам прохождения военной службы военнослужащий в силу требований общевоинских уставов обязан обращаться к непосредственному (а в отдельных случаях — прямому) начальнику.
При изложенным в Вашем вопросе обстоятельствах я рекомендую в первую очередь доложит о сложившейся ситуации командованию, действовать в соответствии с принятым им решением.
Одновременно с этим, учитывая установленную законом (в том числе уголовным) ответственность за неявку к месту прохождения военной службы в установленный срок в том числе из отпуска, рекомендую с подробными обстоятельствами произошедшего направить соответствующий рапорт на имя командира войсковой части с приложением копий подтверждающих невозможность прибытия в срок документов.
В случае необходимости более подробной консультации, а также оказания помощи в правильном составлении рапорта или иных документов, связанных с обжалованием неправомерных требований воинских должностных лиц, обращайтесь ко мне в чат.
Всего доброго!