Как решить вопросы с ген директором и данными?

Добрый день! Благодарю Вас за обращение в Смоленское представительство  «Правовед.РУ».  
Передоверь он не имел полномочий.Лицо, которому выдана доверенность, должно лично совершать те действия, на которые оно уполномочено. Оно может передоверить их совершение другому лицу, если уполномочено на это доверенностью, а также если вынуждено к этому силою обстоятельств для охраны интересов выдавшего доверенность лица и доверенность не запрещает передоверие (ст.187ГК)
Полномочия его определены в доверенности не более. В выписке не может быть два единоличных исполнительных органа это противоречит положениям Устава ООО. В обществе не отсутствовал  коллегиальный исполнительный орган.
При необходимости, Вы всегда сможете обратиться ко мне за помощью. С уважением, юрист в г. Смоленске — Василенков Сергей Васильевич

Добрый день Владимир, по вашему обращению желаю пояснить следующее:

Согласно статье 40 Федерального закона от 08.02.1998 № 14-ФЗ «Об обществах с ограниченной ответственностью» выбирают и назначают директора на должность участники общества. Для этого на общем собрании ПРИНИМАЕТСЯ решение об избрании руководителя. 

С директором заключается Трудовой Договор.  Сведения о новом руководителе ООО нужно передать в налоговую инспекцию, чтобы их внесли в ЕГРЮЛ. На это дается 3 рабочих дня с момента его назначения.
Более детальная информация указанна в ФЗ  «О государственной регистрации юридических лиц и ип» Статья 18. 
«В выписке ЮГРЮЛ данных о „просто директоре“ нет, получается он действует только по доверенности и в рамках прописанных полномочий?»
Да он действует только по довеерености и в рамках полномочий соответственно передоверять свои полномочия не имеет права.