День добрый.
По правилам использования средств маткапитала, квартира (доля в квартире) приобретаемая за счет средств маткапитала должна быть оформлена в долевую собственность всех членов семьи: детей и родителей.
При этом, квартира может быть приобретена за счет собственных средств и средств маткапитала, либо за счет кредитных средств и средств маткапитала.
«Купить долю квартиры у отца» за счет «средств материнского капитала», даже добавив собственные средства, не получится, поскольку действующее законодательство содержит прямой запрет на осуществление сделок по продаже недвижимости между ПРОДАВЦАМИ — дедушкой (бабушкой) и ПОКУПАТЕЛЯМИ — несовершеннолетними внуками.
Средства маткапитала можно было бы направить на погашение кредита на покупку доли квартиры у Вашего отца, поскольку здесь первоначально продаваемая доля будет оформляться на Вас и Вашу супруга. А для использования средств маткапитала Вы с супругой даете нотариальное обязательство о выделении долей после погашения кредита Вашим детям, конечно же по договору дарения. Однако, как правило, банки очень неохотно идут на кредитование недвижимости, покупаемой у близких родственников. Хотя есть шансы, если доказать банку, что сделка по продаже действительно имеет место и бывший собственник доли в квартире (Ваш отец) приобретает себе другую недвижимость и переезжает туда на постоянное место жительства.
Если Вам нужна помощь в сопровождении сделки, обращайтесь.