В соответствии с абзацем вторым части 2 статьи 85 Гражданского процессуального кодекса Российской Федерации эксперт или судебно-экспертное учреждение не вправе отказаться от проведения порученной им экспертизы в установленный судом срок, мотивируя это отказом стороны произвести оплату экспертизы до ее проведения. В случае отказа стороны от предварительной оплаты экспертизы эксперт или судебно-экспертное учреждение обязаны провести назначенную судом экспертизу и вместе с заявлением о возмещении понесенных расходов направить заключение эксперта в суд с документами, подтверждающими расходы на проведение экспертизы, для решения судом вопроса о возмещении этих расходов соответствующей стороной с учетом положений части 1 статьи 96 и статьи 98 Гражданского процессуального кодекса Российской Федерации.
В вашем случае, экспертное учреждение перестраховывается, предоставляя соответствующую скидку, так как учреждению выгоднее сразу получить живые денежные средства, чем ждать окончания судебного процесса, который может затянуться на несколько лет, и придется взыскивать стоимость произведенных работ с ответчика, у которого не всегда имеются официальные регулярные доходы или иное имущество, на которое может быть возложено взыскание долга по экспертизе, в этом и суть скидки, чтобы истце в добровольном порядке оплатил стоимость экпертизы, так как, даже если истец не оплатил экспертизу, экспертное учреждение не вправе отказать передачи ее результатов в суд.