Здравствуйте.
Если квартира является собственностью вашей матери, то на нее не только жена не имеет прав, но и вы тоже являетесь только пользователем, ну, еще и членом семьи собственницы.
Ваша жена всего лишь прописана (зарегистрирована ) в этой квартире и является пользователем и женой члена семьи собственника. Поэтому делить квартиру, принадлежащую вашей матери вы не вправе, если только сама собственница (ваша мама) не согласиться, к примеру, оформить дарственную на вас или внуков, и только, в том случае, если дарственная будет оформлена в долевом отношении на внуков, с ними может проживать ваша бывшая (если вы разведетесь) супруга по праву законного представителя ребенка (детей) если вы определите, что дети будут жить с матерью.
У вас не самая простая ситуация сложится если вы разведетесь: и детей жалко, и жить вместе невозможно, и квартира вам не принадлежит, поэтому делить вам пока нечего, не говоря о том, что что-то «оформлять на жену».
Относительно детей следует учесть, что
Согласно ст.20 Гражданского кодекса РФ местом жительства несовершеннолетних, не достигших четырнадцати лет, или граждан, находящихся под опекой, признается место жительства их законных представителей - родителей, усыновителей или опекунов.
Согласно п. 2 ст. 54 Семейного кодекса РФ несовершеннолетний имеет право жить и воспитываться в семье и право проживать с родителями.
В соответствии со ст. 65 Семейного кодекса РФ (СК РФ) место жительства детей при раздельном проживании родителей устанавливается соглашением родителей, поэтому ребенок может быть зарегистрирован по месту жительства, как отца, так и матери.