Здравствуйте Татьяна.
Согласно Постановлению Правительства РФ
от 13 октября 2008 года N 749
Об особенностях направления работников в служебные командировки
Положение об особенностях направления работников в служебные командировки
Работники направляются в командировки на основании письменного решения работодателя на определенный срок для выполнения служебного поручения вне места постоянной работы. Поездка работника, направляемого в командировку на основании письменного решения работодателя в обособленное подразделение командирующей организации (представительство, филиал), находящееся вне места постоянной работы, также признается командировкой.
http://docs.cntd.ru/document/9...
Т.е. в принципе это вполне возможно. Что касается возмещения расходов по проезду в командировке. в Вашем случае все зависит от внутреннего локального акта действующего в организации и регулирующего порядок возмещения таких расходов, если им прямых запретов не предусмотрено, вы возмещаете все по факту согласно представленным работником документам.