Добрый день Илья.
Я сомневаюсь, что суд определит доли на квартиру при разделе в таком соотношении 90/10. Если только Вы не признаете исковые требования супруги в суде. Супруге будет нужно еще доказать, что первоначальный взнос оплачивался именно за счет личных денежных средств, что обычно сделать очень сложно. Если она этого доказать не сможет, то суд скорее всего просто Вам определит по 1/2 доле каждому.
Возможно я Вас не правильно понял и Вы с супругой хотите определить доли без суда, заключив нотариальное соглашение об определении долей, но тогда Вам будет нужно получить согласие банка на его заключение, что почти не реально.
Что касается кредита, то если супруга выступала созаемщиком в кредитном договоре, то изменение размера долей в праве за квартиру, которая является предметом залога никак не влияет на обязательства сторон по кредитному договору. Ответственность созаемщиков в любом кредитном договоре прописана как солидарная.
Согласно п. 1 ст. 323 ГК РФ При солидарной обязанности должников кредитор вправе требовать исполнения как от всех должников совместно, так и от любого из них в отдельности, притом как полностью, так и в части долга.
То есть, если Ваша супруга не будет платить кредит, то банк имеет право взыскать с Вам обоих задолженность и обратить взыскание на предмет залога в судебном порядке.
Если Вы все же определите доли так, что у Вас будет 10 %, то Уважаемые коллеги ранее Вам все правильно написали про оплату коммунальных и жилищных платежей, я повторяться не буду.
Удачи
По соглашению сторон супруге может быть передано право собственности на всю квартиру и все долги по ипотечному кредиту, а супруга выплатит Вам компенсацию стоимости Вашей доли, что предусмотрено ст. 38 Семейного Кодекса РФ: