Здравствуйте, Наталья!
Обращайтесь в суд за взысканием заработной платы и компенсацией за нарушение срока выплаты заработной платы. Утрата работодателем статуса индивидуального предпринимателя не влияет на его обязанности по оплате задолженности.
Кроме того, можно рассмотреть вопрос о привлечении работодателя к уголовной ответственности по статье 145.1 УК РФ за частичную невыплату заработной платы свыше трех месяцев. Но под частичной невыплатой в данном случае понимается осуществление платежа в размере менее половины подлежащей выплате суммы. Если работодатель каждый месяц платил половину заработной платы, то состава преступления не будет.