Можно ли в судебном порядке урегулировать нарушение режима пребывания в РФ без выезда из РФ?

Я просто учусь, но институт вовремя не продлил миграционную карту. И вот я уже не выезжала 3 месяца.
Пошла в ФМС спросить как быть, там мне ответили, что нужно только выехать на 90 суток, чтобы потом было все нормально, и после 90 суток за пределами РФ нарушение автоматически будет снято. Т.е. мне не поставят запрет и я смогу нормально проживать на территории РФ.
Но можно ли данную ситуацию как-то обжаловать в суде? Не хочу покидать обучение из-за этого и терять 3 месяца.
Надеюсь, более понятно объяснила.

Насколько я понимаю, Вы находитесь в России по студенческой визе.В этом случае университет, в котором вы обучаетесь, является принимающей стороной (п 7 ч. 1 ст. 2 ФЗ "О миграционном учете иностранных граждан и лиц без гражданства в Российской Федерации"). В соответствии с указанным федеральным законом, обязанности по миграционному учету в таком случае возлагаются на принимающую сторону, то есть университет.
Я правильно поняла, что никакие документы Вы не получали?
Рекомендую Вам лично явиться на прием к начальнику Вашего отделения ФМС и предъявить договор с университетом