Добрый день!
В данном случае можно попробовать сослаться на ФЗ «Об образовании», а именно:
Статья 28. Компетенция, права, обязанности и ответственность образовательной организации
6. Образовательная организация обязана осуществлять свою деятельность в соответствии с законодательством об образовании, в том числе:
2) создавать безопасные условия обучения, воспитания обучающихся, присмотра и ухода за обучающимися, их содержания в соответствии с установленными нормами, обеспечивающими жизнь и здоровье обучающихся, работников образовательной организации;
То есть, если с ребенком что-то случится в то время, когда он должен быть на физкультуре, но не присутствовал, то образовательную организацию можно привлечь к ответственности за отсутствие безопасных условий обучения, а также за то, что не организовали должным образом присмотр за учеником.
Если по расписанию идет урок физкультуры, а школьник предоставлен сам себе, то нельзя гарантировать его безопасность. И за любой несчастный случай, который произойдет в эти 45 минут с ребенком, данный преподаватель будет несет ответственность, включая уголовную.
К тому же, ученик должен по образовательным стандартам пройти промежуточную аттестацию, а для этого необходимо наличие оценок. Поэтому он должен выполнять задания, разрешенные по состоянию здоровья (в том числе устные сообщения, письменные рефераты и доклады на заданную тему).
Статья 58. Промежуточная аттестация обучающихся
1. Освоение образовательной программы (за исключением образовательной программы дошкольного образования), в том числе отдельной части или всего объема учебного предмета, курса, дисциплины (модуля) образовательной программы, сопровождается промежуточной аттестацией обучающихся, проводимой в формах, определенных учебным планом, и в порядке, установленном образовательной организацией.
С уважением,
Антоненко Ксения