Факт выплаты заработной платы работнику подтверждается платежными ведомостями или квитанциями расходных ордеров. Вы же наверняка каким-то образом фиксировали выдачу работнику денежных сумм, не так ли? Вот этими документами и подтверждайте.
С 03 октября 2016 срок исковой давности по трудовым спорам о заработной плате увеличен в 4 раза и составит 1 год.
Это означает, что работник вправе взыскать с работодателя долг по заработной плате в течение 1 года с момента, когда работник узнал или должен был узнать о нарушении своего права.
До 03 октября 2016 года работник имел право обратиться в суд за разрешением индивидуального трудового спора в течение трех месяцев.
Никаких встречных исковых требований у Вас как у работодателя в данной ситуации нет