Добрый день!
Согласно подпункту «б» пункта 1 части 1 статьи 95 Закона №44-ФЗ, увеличить объём выполняемой работы можно только по инициативе Заказчика, и то, такое увеличение не должно превышать 10% от общего объема работ. При этом по соглашению сторон допускается изменение с учетом положений бюджетного законодательства Российской Федерации цены контракта пропорционально дополнительному количеству товара, дополнительному объему работы … исходя из установленной в контракте цены единицы… работы ..., но не более чем на десять процентов цены контракта.
Таким образом, Вам необходимо вести переговоры с Заказчиком, о том, что объем работ, предусмотренный контрактом, не соответствует фактическому объему выполняемых работ. Если у Заказчика есть возможность увеличить цену контракта, и он пойдет на встречу, то Вам нужно составить двусторонний акт о необходимости выполнения дополнительного объема работ, и на его основании заключить дополнительное соглашение об увеличении объема работ и цены контракта. Как вариант, можете воспользоваться Вашим правом, предусмотренным статьёй 716 Гражданского кодекса РФ, и приостановить работы до получения от Заказчика указаний о способе выполнения работы. А дальше по обстоятельствам. По инициативе подрядчика, к сожалению, изменения в контракт внести нельзя.