Нет, такие действия неправомерны.
Штатное расписание утверждается приказом руководителя, в котором указывается дата начала действия нового штатного расписания.
Вводить в действие штатное расписание по частям, в частности по одной и той же должности, не допускается и носит дискриминационный характер.
Вместе с тем штатное расписание не является основанием для начисления и выплаты заработной платы в ином объеме, чем предусмотрено трудовым договором.
При заключении нового трудового договора (либо дополнительного соглашения к уже заключенному), добейтесь, чтобы в нем был пункт: положения настоящего трудового договора распространяются на отношения, возникшие с (дата введения штатного расписания).
При таких условиях Вам должны будут сделать перерасчет за прошедший период.