Никита, здравствуйте,
Работаем второй год, но с начала года тянеться подписание договора на 2017
Никита
то есть на 2016 год договор был?
Рекомендации дать сложно, потому что не ясно, о какой работе идет речь, какие документы есть, были ли платежи.
Приостановить работу — официально, насколько я понимаю, вы и не начинали, так как договора нет и доказать выполнение затруднительно. Поэтому оцените последствия исходя из текущей ситуации.
Можно пытаться документировать выполнение работ, направлять письма и т.д., но, опять же, надо знать подробности