Здравствуйте!
Налоговая в регистрации изменений отказала Вам правомерно.
В соответствии с Приказом ФНС России от 25.05.2016 N ММВ-7-14/333@ «О внесении изменений в приложения к приказу Федеральной налоговой службы от 25 января 2012 г. N ММВ-7-6/25@» (Зарегистрировано в Минюсте России 16.06.2016 N 42555):
1. Внести в приложения, утвержденные приказом ФНС России от 25 января 2012 г. N ММВ-7-6/25@ «Об утверждении форм и требований к оформлению документов, представляемых в регистрирующий орган при государственной регистрации юридических лиц, индивидуальных предпринимателей и крестьянских (фермерских) хозяйств» (зарегистрирован Министерством юстиции Российской Федерации 14 мая 2012 г., регистрационный номер 24139), следующие изменения:
в листе И приложения N 1, в листе К приложения N 2, в листе Л приложения N 4, в листе Н приложения N 6, в листе А приложения N 13, в листе Е приложения N 14, в листе А приложения N 16, в листе Е приложения N 17, в пунктах 1.6, 2.16, 5.16, 15.10 приложения N 20 слова «по Общероссийскому классификатору видов экономической деятельности ОК 029-2001 (КДЕС Ред. 1)» заменить словами «по Общероссийскому классификатору видов экономической деятельности ОК 029-2014 (КДЕС Ред. 2)».
Таким образом, при подаче документов для внесения изменений в ОКВЭД нужно руководствоваться новым классификатором ОК 029-2014 (КДЕС Ред. 2).
Документы придется подавать заново.
С уважением Александр