Здравствуйте.
Если отец в квартире проживает, а Вы не проживаете, то он имеет право предъявить к Вам иск о признании Вас утратившей право пользования жилым помещением, поскольку Вы, в силу положений ст.83 ЖК РФ, выехав из квартиры, расторгли в отношении себя договор социального найма и тем самым отказались от прав на проживание в квартире. В случае удовлетворения такого иска Вас могут снять с регистрационного учета в квартире.
Чтобы этого не произошло, Вам необходимо посещать все судебные заседания, указывать суду на то, что Вы выехали из квартиры вынужденно, в связи со сложившимися неприязненными отношениями с отцом, а отец чинит Вам препятствия в пользовании жилым помещением, в квартире имеется Ваши личные вещи и т.п. Все Вами сказанное необходимо подтверждать доказательствами. Например, можете пригласить в суд свидетелей, которые смогут подтвердить Ваши слова.
Можете предпринять уже сейчас определенные действия. Например, оплатите за коммунальные услуги в квартире Вашу часть или обратитесь в суд с иском о разделении лицевых счетов на оплату к.у. В случае если Вам чинят препятствия в пользовании квартирой — обратитесь в полицию (Вам откажут в возбуждении уголовного дела, но у Вас будет зафиксировано намерение вселиться в квартиру).
Если все сделаете правильно, отец не сможет Вас выписать из квартиры ни при каких обстоятельствах.