Здравствуйте, Александр.
Да, нуждающимся в служебном жилье ввиду отсутствия у Вас в собственности жилья по месту службы Вас могут признать и назначить компенсацию за найм жилья.
Думаю, что 6 лет необязательно ждать, имеете право на военную ипотеку и Вас по действующему законодательству из нее не исключат, поскольку в законодательстве в настоящее время пробел, учитывается обеспечение военнослужащего жильем от государства в период его службы, а не вообще.
Федеральный закон от 20.08.2004 N 117-ФЗ
«О накопительно-ипотечной системе жилищного обеспечения военнослужащих»
Статья 9. Участники накопительно-ипотечной системы
3. Основанием для исключения военнослужащего федеральным органом исполнительной власти, в котором федеральным законом предусмотрена военная служба, из реестра участников является:
1) увольнение его с военной службы;
2) исключение его из списков личного состава воинской части в связи с его гибелью или смертью, признанием его в установленном законом порядке безвестно отсутствующим или объявлением его умершим;
3) исполнение государством своих обязательств по обеспечению военнослужащего в период прохождения военной службы жилым помещением (за исключением жилого помещения специализированного жилищного фонда) иным предусмотренным нормативными правовыми актами Президента Российской Федерации способом за счет средств федерального бюджета.
С уважением! Г.А. Кураев