Уважаемая Марина!
Согласно ст.193 Трудового кодекса РФ до применения дисциплинарного взыскания (которым признается в том числе и прогул) работодатель должен затребовать от работника письменное объяснение. Если по истечении двух рабочих дней указанное объяснение работником не предоставлено, то составляется соответствующий акт.
При этом дисциплинарное взыскание может быть применено не позднее месяца с момента его обнаружения.Таким оразом, в описанном Вами случае нарушение сроков допущено не было.
Удачи Вам!