Здравствуйте, Кирилл !
По закону ваши действия оформлены корректно, но есть пара нюансов, о которых честно скажу — потому что они как раз то, за что начальство может цепляться.
Что у вас сделано правильно
Учебный отпуск оформлен официально — по заявлению и справке-вызову. Это обязанность работодателя по ст. 173 ТК РФ, а не его «одолжение». Пока действует такой отпуск, вы освобождены от работы, и отсутствие на рабочем месте — не прогул по определению.
Больничный после отпуска законен. Если болезнь началась уже после окончания учебного отпуска, пособие начисляется с первого дня предполагаемого выхода на работу в общем порядке.
Нюансы, о которых стоит знать
Учебный отпуск имеет целевое назначение— суды подчёркивают, что он выдаётся под аттестацию, а не под отдых. Роструд и большинство судов считают, что работодатель не вправе проверять, был ли работник на сессии: достаточен сам факт справки-вызова, контролировать посещаемость и оценки он не обязан, а удерживать отпускные за «непосещённую» сессию нельзя.
Но есть и противоположная практика: в одном деле суд признал увольнение за прогул правомерным, когда работодатель доказал, что работник фактически не проходил аттестацию и был отчислен, а дни после — квалифицировал как прогул. Если вуз отзовёт справку или работодателю удастся документально установить, что вы на аттестацию не являлись, — вот тут возможен спор. Смягчающий фактор: поездка за границу сама по себе ничего не доказывает, у работодателя нет доступа к вашим перемещениям.
Что вам реально грозит
Увольнение за прогул — маловероятно и легко оспоримо. Пленум ВС прямо указывает: отсутствие по уважительной причине (включая учебный отпуск) прогулом не является. Уволить без соблюдения процедуры (затребовать письменное объяснение, издать приказ) нельзя.
Дисциплинарное взыскание (замечание/выговор) — теоретически возможно, только если работодатель сможет документально доказать, что вы не были на сессии. На практике это трудно: ему пришлось бы запрашивать вуз, а вуз такую информацию сотруднику по телефонному звонку не выдаёт.
Удержание отпускных — незаконно: перечень удержаний из зарплаты закрытый (ст. 137 ТК), случай «не использовал отпуск по назначению» в него не входит.
Что делать сейчас
Не вступайте в перепалку — всё общение переводите в письменный формат: если требуют объяснения, давайте письменно, в двух экземплярах (один с отметкой о принятии оставляйте себе).
Сохраните документы: заявление, справку-вызов, приказ об отпуске, больничный, билет/визу с датами. Если больничный открыт после возвращения — это ваша защита от обвинений в прогуле.
Если давление продолжается (угрозы «уволим за прогул», «вернёшь отпускные») — фиксируйте это: аудиозаписи разговоров с начальством в рамках трудового спора допустимы, переписки сохраняйте.
При реальных действиях (приказ о взыскании, удержание из зарплаты) — жалоба в трудовую инспекцию и прокуратуру; они охотно реагируют на подобные дела, а работодателя за нарушение ждёт штраф по ст. 5.27 КоАП.