Ваша ситуация требует разбора по правовым основаниям: учебный отпуск, выезд за границу и больничный лист.
Краткий предварительный вывод: формально вы не нарушили трудовое законодательство, если больничный лист оформлен корректно. Однако ваши действия создали для работодателя серьезные подозрения в фиктивности больничного, из-за чего он имеет право инициировать проверку. Угрозы начальства, скорее всего, связаны именно с этим, а не с вашим отъездом.
Что нужно сделать прямо сейчас
Проверьте больничный. Убедитесь, что он открыт в государственной поликлинике (или лицензированной частной клинике) и отображается в вашем личном кабинете на портале «Госуслуги». Если он там есть — он официально зарегистрирован в единой системе, и это ваш главный аргумент.
Соберите косвенные доказательства болезни. Сохраняйте чеки из аптек, результаты анализов, назначения врача. Если симптомы были явными (например, высокая температура, подтвержденная вызовом врача на дом), это усилит вашу позицию.
Подготовьте письменное объяснение. Не вступайте в устные перепалки. Если от вас требуют объяснительную записку, спокойно изложите факты: «В период с X по Y находился в учебном отпуске на основании справки-вызова №… По его окончании с Z по W находился за границей (билеты прилагаются по желанию, требовать их работодатель не вправе). В первый рабочий день (дата) почувствовал недомогание, обратился в поликлинику №..., открыт листок нетрудоспособности №...».
Фиксируйте угрозы. Если угрозы (увольнение по статье, штрафы, невыплата денег) поступают устно, начинайте незаметно записывать разговоры на диктофон. Если письменно (в мессенджерах, по почте) — делайте скриншоты. Это понадобится при обращении в Трудовую инспекцию.
Итог
Если больничный лист настоящий, ваши действия правомерны. Работодатель не имеет права вас уволить, оштрафовать или не оплатить больничный. Угрозы начальства в данном случае — это проявление недовольства и подозрений, которые не имеют под собой законной силы при наличии подлинного документа.
Удачи Вам!