Здравствуйте, Сергей.
Сам факт регистрации гражданской жены в Вашем доме не даёт ей долю в собственности и не делает её наследником как супругу, поскольку официальный брак между Вами не зарегистрирован.
Завещание на дочь и внука оформить можно, и в большинстве случаев это действительно позволит определить, кому перейдёт дом после Вашей смерти.
Но есть важный нюанс. Если к тому моменту Ваша сожительница будет нетрудоспособной и сможет доказать, что не менее года находилась у Вас на иждивении и проживала совместно с Вами, у неё в определённых случаях может возникнуть право на наследство, в том числе на обязательную долю независимо от содержания завещания.
Что касается регистрации, если она добровольно выписываться не хочет и семейные отношения фактически прекращены, вопрос можно решать через суд о прекращении права пользования домом и снятии с регистрационного учёта.
Вы можете написать мне в личный чат, там более подробно разберём ситуацию. Важно понять, кому принадлежит дом, на каком основании она была зарегистрирована, проживает ли сейчас фактически и находится ли материально на Вашем содержании. После этого можно определить, достаточно ли завещания или лучше дополнительно решить вопрос с её регистрацией и проживанием.