Анна, здравствуйте. Сначала нужно оформить наследственные права, а не просто подать заявление в Росреестр от двух зарегистрированных жильцов. Регистрация по месту жительства не делает Вас и сестру собственниками.
Пропуск шестимесячного срока не всегда означает, что наследство не принято: продолжение проживания, расходы на содержание и другие действия могут подтверждать фактическое принятие по ст. 1153 ГК РФ. Но одна прописка без таких действий недостаточна. Каждой наследнице нужно подтвердить собственное принятие наследства.
Обратитесь к нотариусу по наследственному делу с документами на квартиру и доказательствами действий после смерти матери. Если фактическое принятие подтверждается, можно получить свидетельства; при споре или недостатке доказательств потребуется суд. Если наследство действительно не принималось, оценивается восстановление срока по ст. 1155 ГК РФ либо согласие всех принявших наследников. После оформления наследства регистрируются доли наследников. Когда умерла мать и кто продолжал жить в квартире и оплачивать её содержание?