Здравствуйте, Елена!
Если дочь в течение 6 месяцев после смерти отца подала нотариусу заявление о принятии наследства, наследство ею уже принято. Получение свидетельства и регистрация права в Росреестре могут быть сделаны и спустя несколько лет, т.к. срок для получения свидетельства законом не ограничен.
Лишить ее наследства только потому, что она живет в Германии и до сих пор не оформила свою долю, нельзя.
Отстранить наследника через суд можно лишь по основаниям ст. 1117 ГК РФ, например как недостойного наследника при доказанных умышленных противоправных действиях против наследодателя или других наследников.
Если квартира была приобретена мужем в браке, сначала может выделяться супружеская 1/2 жены, а оставшаяся половина делится между женой, сыном и дочерью. Тогда доля дочери составит 1/6 всей квартиры.