Здравствуйте, Анатолий.
Ваша ситуация связана с нарушением правил совмещения специальных налоговых режимов. Согласно подп. 7 п. 2 ст. 4 Федерального закона от 27.11.2018 N 422-ФЗ, применение налога на профессиональный доход несовместимо с иными специальными налоговыми режимами, включая УСН.
Поскольку вы зарегистрировали ИП и подали уведомление о переходе на УСН, но не снялись с учета в качестве плательщика НПД, у Вас возник период параллельного существования двух режимов.
Если вы не подали уведомление о прекращении применения УСН в течение месяца со дня постановки на учет в качестве плательщика НПД или наоборот — не отказались от НПД при переходе на УСН, налоговый орган вправе аннулировать вашу постановку на учет в качестве плательщика НПД в соответствии с ч. 5 ст. 15 Федерального закона N 422-ФЗ.
В случае аннулирования статуса НПД все доходы, полученные вами в период самозанятости, т.е. после регистрации ИП, могут быть переквалифицированы и обложены налогами в рамках того режима, который налоговая признает основным, т.е. в вашем случае — УСН или ОСНО.
Если налоговая инспекция не признает за вами право на применение УСН из-за отсутствия или несвоевременности подачи уведомления, вас могут перевести на ОСНО. Это влечет обязанность уплаты НДС и НДФЛ (13%) с доходов, полученных как ИП, а также необходимость сдачи соответствующей отчетности.
Для защиты своих прав в данной ситуации предлагаю Вам подготовить письменные пояснения для налоговой инспекции.
Так как вы подавали декларацию по УСН, уплачивали налог и страховые взносы, а налоговая инспекция принимала эти платежи и не выставляла требований об уплате НДС и НДФЛ ранее, можно ссылаться на то, что налоговый орган фактически признал применение вами УСН. Судебная практика, например, Определение СК по экономическим спорам Верховного Суда РФ от 2 июля 2019 г. N 310-ЭС19-1705 по делу N А62-5153/2017 указывает, что если налогоплательщик фактически применял спецрежим, а инспекция не уведомляла его о необходимости применения ОСНО, перевод на общую систему может быть признан неправомерным:
https://internet.garant.ru/#/document/72286906/paragraph/59:0
В своем пояснении укажите, что вы добросовестно заблуждались относительно порядка совмещения режимов. Подчеркните, что вы фактически вели деятельность по упрощенке, сдавали отчетность и уплачивали взносы.
Если налоговая настаивает на ОСНО, вам придется подать декларации по НДС и 3-НДФЛ. Однако, если вы уже уплатили налог по УСН, эти суммы можно будет зачесть в счет уплаты других налогов или вернуть.
А так, учитывая сложность Вашей ситуации, есть риск доначислений, рекомендую Вам обратиться к профессиональному налоговому юристу-консультанту для качественной подготовки ответа в ИФНС.
Что значит «поставил»? Выбор налогового режима совершает субъект предпринимательства, а не кредитная организация, где он обслуживается. Соответственно, Вы должны были подать заявление об этом в налоговый орган (ч. 1 ст. 346.11, ч. 1 ст. 346.13 НК РФ).
А почему от банка?
Всё правильно Вам сказали. Без вашего заявления налоговый режим за Вас никто не выберет. И не совсем понятно, почему налоговый орган сделал такой вывод.
Вы и есть ИП. Статуса «самозанятого» у Вас больше нет, т.к. Вы получили статус ИП.
Логично… Вы должны были по-прежнему применять ПСН. А если Ваша деятельность не подпадала под ПСН, то налогообложение осуществляется на общих основаниях — ОСН. При этом Вы должны были платить НДФЛ со своих доходов, НДС, страховые взносы за себя + иные налоги при необходимости.
Надо по-хорошему почитать уведомление налогового органа. И уже потом делать выводы.