Да, при описанных обстоятельствах отсрочка должна сохраниться, точнее — у Вас сохраняется право на ее предоставление по вузу №1, если Вы обучаетесь очно, программа имеет государственную аккредитацию и ранее призывная комиссия не предоставляла Вам отсрочку по вузу №2.
По ст. 24 ФЗ №53-ФЗ право на отсрочку имеют обучающиеся очно по аккредитованным программам бакалавриата или специалитета, если нет диплома бакалавра, специалиста или магистра; такая отсрочка предоставляется на период обучения и, как правило, один раз.
По п. 17 Положения о призыве, утв. Постановлением Правительства РФ №663 решение о предоставлении отсрочки принимает именно призывная комиссия, а не вуз; при отсутствии электронных сведений право подтверждается справкой из вуза по форме приложения №4.
Поэтому сейчас Вам нужно получить в вузе №1 справку об обучении по форме для военкомата, взять копию приказа о зачислении, проверить аккредитацию программы, а из вуза №2 получить копию приказа об отчислении по собственному желанию. В военкомат подавайте документы только по вузу №1 и при необходимости приложите подтверждение, что по вузу №2 отсрочка не оформлялась.
Если военкомат откажет или вынесет решение о призыве, такое решение нужно обжаловать в призывную комиссию субъекта РФ или в суд.
Если у Вас остались вопросы — буду рад помочь в чате
С уважением, Н.А. Абаринов