Здравствуйте!
Да, оформить пенсию по потере кормильца через военкомат без участия матери можно. Я поясню, как это работает, чтобы у вас не возникло сложностей на месте.
Суть в том, что право на такую пенсию (её ещё называют «военная пенсия по потере кормильца») по закону (в частности, по Закону РФ № 4468-1) имеют нетрудоспособные члены семьи, которые состояли на иждивении погибшего военнослужащего. То есть ключевое — факт зависимости, а не обязательно родство с матерью.
Например, право на пенсию часто возникает у несовершеннолетних детей, у супруга (если он нетрудоспособен или ухаживает за малолетними детьми погибшего и не работает), у родителей. Мать в этом списке не всегда фигурирует как обязательный получатель — всё зависит от обстоятельств.
Поэтому, если мать по каким-то причинам не может или не хочет подавать заявление (например, она лишена родительских прав, умерла или просто не участвует в жизни ребёнка), заявителем может выступить другой человек. Это может быть отец, опекун, другой родственник или даже сам ребёнок (если он достиг возраста, с которого возникает право на пенсию — например, 14 лет для лица, ухаживающего за младшими детьми). Главное — чтобы у этого человека были законные полномочия (например, решение органа опеки, доверенность).