Здравствуйте.
Ключевой вопрос здесь - использовался ли материнский (семейный) капитал при покупке или строительстве этого дома. Если да - по ст. 10 ФЗ № 256-ФЗ дом в обязательном порядке должен быть оформлен в долевую собственность на всех членов семьи, включая обеих детей. Невключение второй дочери в этом случае - прямое нарушение закона, и любая сделка по продаже доли отца без предварительного выделения доли ребёнку может быть признана недействительной.
Если маткапитал не использовался - ситуация сложнее. Закон не обязывает родителей делить своё имущество между детьми поровну. Доли в доме, о которых Вы пишете (по три на человека), скорее всего распределены между супругами и старшей дочерью добровольно, по соглашению или дарению. У второй дочери в этом случае автоматического права на долю нет - только через дарение родителями, через завещание либо через суд, если при разводе Вы заявите об отступлении от равенства долей супругов в интересах несовершеннолетних детей (ст. 39 СК РФ). Но суд обязан это учесть, а не обязан удовлетворить требование.
При этом сама продажа доли мужем третьему лицу возможна только с соблюдением преимущественного права покупки других сособственников - жены и старшей дочери (ст. 250 ГК РФ). Это отдельный рычаг, которым можно временно заблокировать сделку и потянуть время, чтобы решить вопрос со второй дочерью.
Дальше всё зависит от того, был ли маткапитал, и сколько ребёнку лет сейчас. От этого будет строиться разная тактика - через суд, через нотариуса или через опеку.