Здравствуйте! Да, право на отсрочку в такой ситуации может сохраниться, если соблюдены условия статьи 24 ФЗ «О воинской обязанности и военной службе». Академический отпуск сам по себе отсрочку не прекращает, если общий срок обучения увеличился не более чем на один год. Перевод в другой вуз на очную форму тоже обычно не лишает отсрочки, если образовательная программа того же уровня и перевод оформлен официально.
Но проблема сейчас в другом — военкомат, судя по всему, не получил документы о переводе. Поэтому для них сын может числиться отчисленным из первого вуза. Из-за этого и пришла повестка.
Нужно как можно быстрее предоставить в военкомат справку об обучении из нового вуза, приказ о переводе и желательно документы по академическому отпуску. Обычно подойдет справка по форме приложения №4 к Постановлению Правительства РФ №663. Если повестка пришла через Госуслуги, игнорировать её не стоит.
Если перевод был без разрыва и обучение очное, шансы сохранить отсрочку хорошие. С наилучшими пожеланиями, Хабас Феликсович.