Здравствуйте. По вашему описанию ситуация серьёзная, потому что речь может идти о самовольном оставлении места службы или неявке в срок на службу, особенно с учётом того, что он уже покидал госпиталь, скрывался, был объявлен в федеральный розыск и сейчас находится в военной комендатуре.
Окончательно сказать, чем закончится дело, можно только после понимания, возбуждено ли уже уголовное дело, по какой статье, какой у него статус — подозреваемый, обвиняемый или пока только проводится проверка, а также какие документы есть по госпиталю, ранению, состоянию здоровья и причинам ухода. Обычно в подобных ситуациях военные следственные органы проверяют, были ли уважительные причины отсутствия, находился ли он на лечении, мог ли он осознавать последствия своих действий, уведомлял ли командование, были ли медицинские документы, подтверждающие невозможность возвращения в часть.
Если он самовольно покинул госпиталь без разрешения и находился в розыске, риск уголовной ответственности действительно есть. При этом наличие ранения, лечение, состояние здоровья, рождение ребёнка, семейные обстоятельства могут иметь значение, но сами по себе не освобождают от ответственности. Их нужно правильно представить как смягчающие обстоятельства либо как обстоятельства, объясняющие его поведение, если были медицинские или психологические причины.
То, что сейчас он находится в военной комендатуре и там работает, не означает, что вопрос закрыт. Его могут либо вернуть в часть, либо передать материалы в военный следственный отдел, либо избрать меру пресечения, либо в дальнейшем направить дело в гарнизонный военный суд. Поэтому сейчас главное — не ждать, а срочно понять процессуальный статус и собрать документы.
Ему желательно не давать подробные объяснения без защитника, особенно если его опрашивают по фактам ухода из госпиталя и скрывания. Нужно запросить сведения, возбуждено ли уголовное дело, обеспечить участие адвоката, собрать все медицинские документы по ранению, госпиталям, выпискам, заключениям врачей, а также документы о ребёнке. Если есть основания, можно ставить вопрос о направлении на ВВК и оценке состояния здоровья.
Если хотите, можете обратиться в личный чат — помогу подготовить обращения в военную прокуратуру/следственный орган, разобраться со статусом дела и выстроить позицию защиты, чтобы минимизировать риски по уголовной ответственности.