Здравствуйте.
Трудовой договор и должностная инструкция должны быть согласованы между собой, и в случае противоречий приоритет имеет трудовой договор, поскольку он является основным документом, регулирующим трудовые отношения между работником и работодателем.
Поскольку Вы длительное время исполняете обязанности, закреплённые в должностной инструкции, при отсутствии официального изменения трудового договора, это свидетельствует о фактическом изменении условий труда.
Требование о привлечении к дисциплинарной ответственности за неисполнение обязанностей, не соответствующих фактической работе, является неправомерным и может быть оспорено в порядке ст. 382 ТК РФ.
Принуждение к увольнению путём создания невозможных условий контроля или предъявления необоснованных претензий образует признаки нарушения ст. 81 ТК РФ и может повлечь восстановление на работе, взыскание среднего заработка и компенсации морального вреда (ст. 234, ст. 237 ТК РФ).
Готов оказать дистанционную правовую поддержку по вашему вопросу, включая:
анализ документов (трудовой договор, должностная инструкция, приказы, переписка),
составление мотивированных возражений на приказы,
подготовку жалобы в ГИТ или искового заявления в суд.
С уважением, Александр.