Можем ли мы их выписать без их согласия?

Выписать сестру с ребёнком-инвалидом из родительского дома без их согласия можно только через суд. Это общее правило, которое распространяется на всех прописанных в жилом помещении лиц, не являющихся его собственниками. Статус ребёнка-инвалида сам по себе не даёт автоматического права на сохранение регистрации, но может повлиять на решение суда с учётом конкретных обстоятельств дела. 

Основания для принудительной выписки через суд

Собственник жилья (или наниматель в случае муниципального жилья) может подать в суд иск о признании лица утратившим право пользования жилым помещением и снятии с регистрационного учёта. Суд может удовлетворить такой иск, если будет доказано, что:

Ответчик фактически не проживает в квартире и не несёт бремя её содержания (например, не оплачивает коммунальные услуги). 
У ответчика есть другое место жительства. 
Регистрация была фиктивной. 
Между собственником и прописанным лицом прекращены семейные отношения (если речь о членах семьи собственника). 
В случае с несовершеннолетним ребёнком-инвалидом суд также учтёт интересы ребёнка и соблюдение его прав. Например, важно, есть ли у ребёнка другое пригодное для проживания место, соответствует ли оно его состоянию здоровья, учтены ли требования индивидуальной программы реабилитации.