Ситуация такова: у моей гражданской супруги есть сын 13 лет, у неë скоро судебное разбирательство, возможно еë лишат свободы, инспектор ПДН уже начала собирать документы для отправки ребëнка в спец

Здравствуйте,  требование инспектора ПДН пройти медкомиссию — это законно, так как она нужна для заключения психолого-медико-педагогической комиссии (ПМПК), которая определяет, нуждается ли ребенок в особых условиях обучения или нет. Без согласия законного представителя отправить его туда не могут, в любом случае с мамой будут отдельно беседовать на эту тему.  Если вашу супругу лишат свободы, вам нужно срочно оформлять опеку над ребенком, чтобы иметь законное право голоса. Если ПДН будет настаивать на отправке, а вы будете против, вы имеете полное право обжаловать это решение в прокуратуре или суде. Поэтому ваша главная задача — не паниковать, но подготовиться к тому, чтобы официально представлять интересы мальчика. Если нужна дополнительная консультация. Пишите. 

Что делать в вашей ситуации?
Ваша цель — доказать, что у семьи есть ресурс для заботы о ребенке, и что помещение в спецшколу не является единственным выходом.

Не препятствуйте медкомиссии, но участвуйте в ней.
Пройдите обследование. Это даст вам объективную картину здоровья ребенка. Вы имеете право знать результаты и получить копии заключений.
Срочно определите законного представителя ребенка.
Это самый важный шаг. Если вашу супругу лишат свободы, ребенок не может остаться без законного представителя. В идеале, пока супруга на свободе, ей нужно оформить на вас нотариально заверенное согласие на представление интересов ребенка или, если вы проживаете вместе и ведете общее хозяйство, собрать документы, подтверждающие, что вы фактически исполняете родительские обязанности. Это позволит вам участвовать в судах, забирать ребенка из школы, представлять его интересы в госорганах.
Подготовьте позицию для суда (если дело дойдет до рассмотрения вопроса о спецшколе).
Суду нужно будет доказать, что ребенок не находится в социально опасном положении и что его воспитание возможно в семье (даже неполной). Для этого можно:

Получить характеристику на ребенка из школы (желательно положительную, от классного руководителя).
Собрать характеристики на вас от соседей, с работы.
Обратиться к школьному психологу для беседы с ребенком, чтобы он дал заключение об его эмоциональном состоянии и привязанности к вам.
Если у ребенка есть комната/место для занятий, спальное место — это тоже важно.
Обратитесь в Комиссию по делам несовершеннолетних (КДН).
Не ждите, пока инспектор ПДН соберет все документы. Сами идите на прием в КДН. Объясните ситуацию: мать ребенка может быть осуждена, но ребенок не остается безнадзорным, вы готовы заботиться о нем и не допускать противоправного поведения. Узнайте, на каком основании ПДН инициирует сбор документов. Совершил ли ребенок что-то? Или это делается «на всякий случай» из-за будущего осуждения матери?
Изучите возможность альтернативы.
Если супругу осудят, у нее есть права, связанные с ребенком. Например, осужденные женщины с детьми до 14 лет имеют право на дополнительные длительные свидания -7. Это подтверждает, что государство поддерживает связь ребенка с осужденным родителем, а не стремится автоматически его изолировать.