Заказал на сына машину из японии, фактически проживаем в иркутской области, но для оплаты таможенных платежей по льготе, необходима временная прописка в Владивостоке

Здравствуйте! Если у вас есть временная регистрация то личное присутствие не обязательно. Чтобы оформить временную регистрацию необходимо: 

Временную регистрацию можно оформить дистанционно через портал «Госуслуги» без личного присутствия во Владивостоке. Для этого потребуется:

Зайти на сайт или в приложение «Госуслуги».
Перейти в раздел «Паспорта, Регистрация» → «Регистрация по месту жительства или пребывания» → «Регистрация по месту пребывания в жилом помещении».
Выбрать электронный тип свидетельства.
Указать данные собственника жилья, в котором планируется регистрация (если собственник не вы — потребуется его согласие).
Указать адрес временной регистрации во Владивостоке и срок действия регистрации (рекомендуется выбирать срок с запасом, чтобы регистрация действовала на момент прибытия автомобиля на таможню). 
Для оформления также могут понадобиться сканы или фото страниц паспорта (основной разворот, страница с пропиской, семейное положение, информация о военной обязанности при необходимости). 

Нужно ли личное присутствие во Владивостоке

При наличии временной регистрации во Владивостоке личное присутствие собственника автомобиля на таможне не требуется. Менеджер сможет оформить растаможку с использованием предоставленных документов, включая заверенные копии паспорта и данные о временной регистрации. 

Если мне удалось ответить на Ваш вопрос пожалуйста оставьте отзыв.