Поменять Устав или ограничиться протоколом собрания учредителей?

Саргылана, здравствуйте!

В ООО каждый учредитель обязан оплатить свою долю в уставном капитале в срок, установленный законом и уставом (обычно до 4 месяцев с момента регистрации общества). В случае, если учредитель не оплатил долю, он может быть исключён из общества, а его доля переходит к самому обществу. Если учредитель хочет выйти добровольно, то его доля должна быть либо выплачена ему (если оплачена), либо перераспределена между оставшимися участниками.

В Вашем случае Протокола собрания достаточно, чтобы оформить выход и перераспределение доли.
Устав менять нужно только в том случае, если в нём нет положения о выходе участника или порядке распределения неоплаченной доли.

С уважением, Афанасьев Вячеслав!