На каких то условиях и повторно этот самый НДС не платить?

У коллег мнение разошлись: ктото говорит что разные системы налогооблажения и взять к вычету авансы полученные с другой системы налогообложения нельзя

Нет, система налогообложения здесь точно не играет роли, так как в любом случае вы как были так и остаетесь плательщиком НДС.

Единственная проблема, которая здесь может возникнуть, это п.6. ст.172 НК РФ, в котором сказано что вычет с авансов можно получить в размере налога, исчисленного исходя из стоимости отгруженных (переданных) товаров (выполненных работ, оказанных услуг). Данная формулировка достаточно противоречива применительно к ситуации, когда НДС с реализации исчисляется, но уже по пониженной ставке. 

В такой ситуации, если со стороны налоговой имеются претензии, то полагаю самым разумным будет заключить соглашение о возврате аванс, так как в случае возврата (п.4. ст.172 НК РФ) нет никаких ограничений по сумме налога. 

… одним из вариантов такого возврата является частичный возврат аванса на сумму уменьшения налога — при нём Минфин позволяет делать вычет, как указал коллега Юрий Колковский. 

Дополню.

В этом случае можно применить вычет НДС с аванса в том периоде, когда его зачтут в счет оплаты реализации (п. 17 Методических рекомендаций по НДС для УСН, письмо ФНС от 17.10.2024 № СД-4-3/11815@).

Тут есть проблема, которая пока не имеет официальных разъяснений. Если исходить из положений п. 8 ст. 171 в сочетании с п. 6 ст. 172 НК РФ, вычет НДС с аванса может быть только в пределах суммы налога, исчисленной с реализации. Например, НДС с аванса исчислили по расчетной ставке 20/120, а при зачете аванса в счет оплаты реализации — по ставке 7%. Значит, зачесть получится только соответствующую часть НДС с аванса.

Варианта тут в Вашем случае два — заплатить НДС с аванса по ставке 20/120 в периоде его получения, а затем применить вычет НДС с аванса в пределах налога, исчисленного при реализации по ставке 7% либо
до момента реализации подписать с контрагентом допсоглашение об уменьшении цены договора в связи с изменением ставки НДС с 20% до 7%. Затем вернуть контрагенту разницу в НДС, применить вычет НДС с разницы в периоде ее возврата, а с оставшейся суммы — в периоде реализации.

Как-то так.

Дополнение. Нашел Письмо Минфина России от 31.03.2025 N 03-07-11/31401 в котором прямо указано:

Таким образом, при реализации с 1 января 2025 г. товаров (работ, услуг), подлежащих налогообложению НДС по налоговым ставкам в размере 5 и 7 процентов, налогоплательщикам, получившим до указанной даты суммы предварительной оплаты (частичной оплаты), по которой НДС был исчислен и уплачен в бюджет по налоговым ставкам в размере 10 и 20 процентов, возможно руководствоваться следующим:
— если в договор о реализации товаров (работ, услуг) внесены изменения, согласно которым стоимость товаров (работ, услуг) уменьшена на соответствующую сумму НДС, то сумма НДС, исчисленная и уплаченная при получении предварительной оплаты (частичной оплаты), возвращенная покупателю товаров (работ, услуг) на основании изменений к договору, принимается к вычету;
— если в договор о реализации товаров (работ, услуг) внесены изменения, согласно которым стоимость этих товаров (работ, услуг) с учетом НДС, исчисленного по налоговой ставке в размере 5 или 7 процентов, соответствует ранее установленной стоимости товаров (работ, услуг) с учетом НДС, исчисленного по налоговой ставке в размере 10 или 20 процентов, то сумма НДС, исчисленная и уплаченная при получении предварительной оплаты (частичной оплаты), принимается к вычету только в размере суммы НДС, исчисленного при отгрузке товаров (выполнении работ, оказании услуг).