Здравствуйте.
Наследственная трансмиссия наступает в том случае, если наследник призывающейся очереди или наследник по завещанию не успев его принять, умер. -см. п.1 ст.1156 ГК РФ.
Вы указываете, что
Мой папа умер. Я и мой дедушка подали заявление нотариусу.
То есть речь идет о том, что дедушка не успел получить свидетельство о праве на наследство, но принять наследство он успел, так как одним из способов принятия наследства является подача нотариусу соответствующего заявления. — см. ст.1153 ГК РФ
Дедушка вообще мог, если был бы жив, сколько угодно времени не получать свидетельство о праве на наследство, но все равно считался бы принявшим наследство.
Таким образом, оснований наследовать кому-либо в порядке наследственной трансмиссии нет.
Доля в имуществе, причитающаяся деду после смерти Вашего отца, войдет в состав наследства, оставшегося после смерти деда и будет унаследована его наследниками в равных долях. А таковыми являетесь Вы и Ваш дядя (см. ст.1112, ст.1141, ст.1142, ст.1146 ГК РФ). Вам следует подать заявление нотариусу о принятии наследства после смерти деда.
С уважением