Здравствуйте, Виктория!
Справка об оплате медицинских услуг для представления в налоговые органы РФ заполняется всеми учреждениями здравоохранения, имеющими лицензию на осуществление медицинской деятельности, независимо от ведомственной подчиненности и формы собственности. (Инструкция, утв. приказ Минздрава РФ и МНС РФ N 289/БГ-3-04/256).
Справка удостоверяет факт получения медицинской услуги и выдается после оплаты медицинской услуги по требованию налогоплательщика.
Более подробно с приказом Минздрава РФ и МНС РФ N 289/БГ-3-04/256 можете ознакомиться по ссылке https://base.garant.ru/12123935/f7ee959fd36b5699076b35abf4f52c5c/
И как грамотно, с какими доводами ответить клинике на их отказ?
На основании Инструкции обязаны выдать.
В Справке указывается код оказанных медицинским учреждением услуг, которые оплачивались за счет налогоплательщика: «1» — «обычное» лечение; «2» — дорогостоящее лечение,
Вот здесь сложнее.
Отнесение оказанной услуги, к услуги за которую предоставляется налоговый вычет это компетенцию медицинской организации ее оказывающей.