Здравствуйте.
За период с даты когда будет установлено, что были уважительные причины неявки в часть его должны восстановить в силу пункта 107 Порядок обеспечения денежным довольствием военнослужащих Вооруженных Сил Российской Федерации и предоставления им и членам их семей отдельных выплат, приказ МО РФ от 6 декабря 2019 г. N 727.
За период когда будет установлено, что военнослужащий находился в СОЧ денежное довольствие выплате не подлежит в силу пункта 108 того же Порядка.
То есть, если объявлен приказом в СОЧ, например с 1 сентября 2024 по ноябрь 2024 года, но в ходе разбирательства будет установлено, что с 1 сентября по 30 сентября военнослужащий, например болел, лежал в стационаре, то за этот период выплаты восстановят, а за периоды за которые не будет подтверждено уважительных причин не выхода на службу не восстановят.
Вот уважительные причины согласно Пленума Верховного Суда