Служу по контакту уже 5 лет и ни разу не видел книгу учёта переработки, скажите это вообще законно что его не ведут?

Здравствуйте, Сергей,

Согласно «Порядка деятельности должностных лиц и органов военного управления по организации прохождения военной службы по контракту в Вооруженных Силах Российской Федерации» (Приложение N 1 к приказу Министра обороны РФ от 30 октября 2015 г. N 660):

25. Учет времени привлечения военнослужащих, проходящих военную службу по контракту, к исполнению обязанностей военной службы в рабочие дни сверх установленной продолжительности еженедельного служебного времени, привлечения этих военнослужащих к исполнению обязанностей военной службы в выходные и праздничные дни и предоставленного им дополнительного времени отдыха ведется в журнале по форме и в порядке в соответствии с приложением N 7 к настоящему Порядку*(11).

https://base.garant.ru/71279420/53f89421bbdaf741eb2d1ecc4ddb4c33/

Вот образец такого журнала -

https://base.garant.ru/71279420/a79dffbd05f9bf09e1f9c171c3bd6350/

и её ведут без нашего участия, что тогда делать?

Без участия военнослужащего этот журнал вести нельзя. 

Так как, согласно п. 7 «Порядка ведения журнала учета времени привлечения военнослужащих, проходящих военную службу по контракту, к исполнению обязанностей военной службы в рабочие дни сверх установленной продолжительности еженедельного служебного времени, привлечения этих военнослужащих к исполнению обязанностей военной службы в выходные и праздничные дни и предоставления им дополнительного времени отдыха»:

7. Учет соответствующего времени анализируется командиром подразделения воинской части и доводится до военнослужащих под роспись еженедельно.

Тем самым, этот учет должен доводиться под роспись военнослужащему (подпись ставится в разделе 13 журнала).

Если под роспись не доводится — значит журнал не ведется.

Вам следует обратиться по этому вопросу с жалобой в военную прокуратуру.

Желаю удачи,