Добрый день, Юлия.
Ответить на ваш вопрос о возможности внесения изменений, можно только изучив соглашение с лицензиаром, см. ст. 1235 ГК РФ
По лицензионному договору одна сторона — … лицензиар предоставляет или обязуется предоставить другой стороне (лицензиату) право использования такого результата или такого средства в предусмотренных договором пределах.
Отмечу, что отсутствие ограничения на внесение изменений — не означает согласие с такими действиями. То есть нужно проанализировать не только условия об ограничениях, но и условия с разрешенными действиями.
См. ст. 1229 ГК РФ
Правообладатель может по своему усмотрению разрешать или запрещать другим лицам использование результата интеллектуальной деятельности или средства индивидуализации. Отсутствие запрета не считается согласием (разрешением).
Из ваших пояснений следует, что Вы создатель логотипа, видимо по договору авторского заказа или договору оказания услуг с элементами договора об отчуждение исключительных прав или иному подобному договору. Опять обращаю внимание, что нужно очень подробно проанализировать лицензионное соглашение с правообладателем шрифта. Есть разные варианты, кто-то разрешает любое использование после приобретения лицензии, в том числе передачу прав на созданные с использованием шрифтов изображения, кто-то ограничивает использование шрифтов определенными направлениями. Например, этот шрифт можете использовать только Вы, но не ваш заказчик. Поэтому ему также потребуется отдельно приобрести права на использование данного шрифта.
Если, исходя из содержания соглашения, прав у заказчика нет, то в ФИПС ему скорее всего данный логотип зарегистрируют, но в будущем, если правообладатель обнаружит нарушение, он может предъявить претензии к вашему заказчику, а тот в свою очередь привлечь Вас.
Юлия, можно выложить лицензию. Посмотрим ограничения какие есть.