Выяснилось что он не платил за ЖКХ, образовался большой долг и набежали пени, если ли законная возможность списать пени, за сроком давности или по какой либо еще причине?

Добрый день! 

Вы как наследник в соответствии со ст. 1175 ГК РФ отвечаете по долгам наследодателя. 

Однако срок исковой давности можно применить, но только в рамках рассмотрения уже искового заявления. 

Вначале со стороны управляющей компании будет подано заявление о вынесении судебного приказа. 

Его модно отменить просто указав в возражении на то, что Вы не согласны с суммой указанной в заявлении о вынесении судебного приказа. 

Если в установленный срок Вы подадите возражение судебный приказ отменят. 

Срок исковой давности составляет 3 года и по повременным платежам течет согласно ч. 2 ст. 200 ГК РФ начинается по окончании срока исполнения.

Пени ( неустойку) можно просить уменьшить согласно ст. 333 ГК РФ.