Здравствуйте!
У собственника оформлена только земля, соответственно документы только на землю, на участкк есть небольшой дом.
Поскольку зарегистрировано право собственности только на земельный участок, то предметом сделки ( купли-продажи) будет только земельный участок. И приобретете Вы право собственности по договору только на земельный участок.
Вы можете предложить собственнику земельного участка оформить право собственности на дом перед продажей, он сможет это сделать по дачной амнистии, согласно Федеральному закону от 30.12.2021 N 478-ФЗ «О внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации»
Необходим будет технический план садового дома для этого.
Да, вначале составляете договор купли-продажи земельного участка, а потом обращаетесь в МФЦ