Виталий,
с увольнением вопрос само собой разумееющийся — уволиться можно в любое время. Никто не вправе насильно удерживать человека в должности.
А вот с заявлением не всё так просто.
В данном случае потерпевшим и гражданским истцом в уголовном деле является юридическое лицо, но поскольку юр.лицо — лицо неодушевлённое, то в уголовном (как и в гражданском) процессе принимает участие егопредставитель.
Представителю и разъясняют следователь и судья права потерпевшего.
Без доверенности представлять юр.лицо может только ген.директор.
Вновь назначенный ген.директор может иметь иную точку зрения по поводу действий главбуха.
Он может написать новое заявление в адрес лица, проводящего доследственную проверку и указать, что организация провела внутреннюю документальную ревизию и по её результатам не имееет претензий к главбуху, в связи с чем проверку просит прекратить.
В этом случае в возбуждении уголовного дела будет отказано.
Поэтому, если увольняющийся гендиректор имеет целью наказание нечистого на руку главбуха, ему лучше оставаться на своём посту до принятий соответствующих уголовно-процессуальных решений (предъявление обвинения, направление дела прокурору для утверждения обвинительного заключения, приговор суда).
А заявление как отметил коллега будет рассматриваться в полиции само собой.