Здравствуйте, Сергей!
В соответствии с абз. 1 ст. 11 ФЗ «О социальной защите инвалидов в Российской Федерации» индивидуальная программа реабилитации инвалида — комплекс оптимальных для инвалида реабилитационных мероприятий, включающий в себя отдельные виды, формы, объемы, сроки и порядок реализации медицинских, профессиональных и других реабилитационных мер, направленных на восстановление, компенсацию нарушенных функций организма, формирование, восстановление, компенсацию способностей инвалида к выполнению определенных видов деятельности.
На сколько я понял из заданного вопроса, уполномоченный орган определил срок индивидуальной программы реабилитации инвалида в 3 года. Он на это имеет право в соответствии с законом. Вам необходимо будет заново оформлять индивидуальную программу реабилитации инвалида.
С уважением,
Дмитрий Алексеевич Егоров.