Но на работе посоветовали оформить алименты через суд и в % от зарплаты

Здравствуйте, Сергей!

Расторгнуть нотариальное соглашение об уплате алиментов в одностороннем порядке можно только в судебном порядке. 
Расторгнуть во внесудебном порядке можно только по взаимному согласию.
СК РФ Статья 101. Порядок заключения, исполнения, изменения, расторжения и признания недействительным соглашения об уплате алиментов
Соглашение об уплате алиментов может быть изменено или расторгнуто в любое время по взаимному согласию сторон.

За более подробной консультацией, составлением юридических документов Вы можете обратится к любому юристу сайта через чат, в том числе ко мне!
Готов помочь! Пишите в чат: https://pravoved.ru/lawyer/135...

С уважением,
юрист Павел Гайкалов

Добрый день, Сергей!

СК РФ Статья 101. Порядок заключения, исполнения, изменения, расторжения и признания недействительным соглашения об уплате алиментов

Перспективы и риски споров в суде общей юрисдикции. Ситуации, связанные со ст. 101 СК РФ
Развернуть
Как признать соглашение об уплате алиментов недействительным
1. К заключению, исполнению, расторжению и признанию недействительным соглашения об уплате алиментов применяются нормы Гражданского кодекса Российской Федерации, регулирующие заключение, исполнение, расторжение и признание недействительными гражданско-правовых сделок.

2. Соглашение об уплате алиментов может быть изменено или расторгнуто в любое время по взаимному согласию сторон.

Изменение или расторжение соглашения об уплате алиментов должно быть произведено в той же форме, что и само соглашение об уплате алиментов.

3. Односторонний отказ от исполнения соглашения об уплате алиментов или одностороннее изменение его условий не допускаются.

4. В случае существенного изменения материального или семейного положения сторон и при недостижении соглашения об изменении или о расторжении соглашения об уплате алиментов заинтересованная сторона вправе обратиться в суд с иском об изменении или о расторжении этого соглашения. При решении вопроса об изменении или о расторжении соглашения об уплате алиментов суд вправе учесть любой заслуживающий внимания интерес сторон.

В случае, если у бухгалтерии не будет достаточной суммы для удержания ввиду наличия больничного/отпуска, у Вас образуется задолженность, которая будет вычитаться из дальнейших денежных выплат. 

В данном случае, Вам необходимо определиться в том, хотите ли Вы снижать размер алиментов, установленный нотариальным соглашением. Если да, то снизить размер алиментов, установленных добровольным нотариальным соглашением, возможно при обоюдном на то согласии сторон путем нотариального внесения изменений в условия документа (п. 2 ст. 101 СК РФ), а при одностороннем желании – путем обращения в суд (п. 4 ст. 101 СК РФ).