Здравствуйте, вообще, согласно ст. 9 Федерального закона от 06.12.2011 N 402-ФЗ «О бухгалтерском учете»
первичный учетный документ должен быть составлен при совершении факта хозяйственной жизни, а если это не представляется возможным — непосредственно после его окончания.
УПД как счет-фактура должен быть оформлен в течение пяти календарных дней с даты отгрузки товара или реализации услуг. Это следует из положений пункта 3 статьи 168 НК.
Так, что нарушения по техническим моментам у Вас имеется, но это не основания требовать неустойки, так неустойка по правилам ст. 330 ГК РФ -
определенная законом или договором денежная сумма, которую должник обязан уплатить кредитору в случае неисполнения или ненадлежащего исполнения обязательства.
Обязательства у Вас, насколько я понял, исполнены в срок и надлежащим образом. Если у Вас, конечно, прямо договором не установлено право на неустойку в случае направления УПД не в срок
Согласно п. 1 ст. 513 ГК РФ
покупатель (получатель) обязан совершить все необходимые действия, обеспечивающие принятие товаров, поставленных в соответствии с договором поставки.
В Вашей ситуации, если по каким-то причинам документы не были в этот 30-дневный по договору срок переданы, но фактически обязательства по договору исполнены – заказчик должен подписать и отправить обратно, хотя бы числа и не будут совпадать – подписание УПД и отгрузка с исполнением работ.
Выясните причины почему заказчик не подписывает документы, направьте ему официально требование о необходимости подписания документа, предупредите об ответственности по ст. 120 НК РФ. Зафиксируйте факт направления требования о подписании УПД.
В остальном — договор нужно смотреть, мотивы точно знать неподписания, надлежащее ли у Вас, у него исполнение было и т.п. Зафиксируйте сначала всё официальным направлением требования-претензии, чтобы у Вас документы были, что Вы направляли УПД, а также требовали его подписать.
Надо доказывать обратное, если до суда дойдет - согласно ст. 56 ГПК РФ
Перечень доказательств в ст. 55 ГПК РФ, в том числе свидетельские показания, могут быть и косвенные, например, какие-то письменные доказательства того, что от Вас машина выходил загруженная товаром, например, путевой лист какой-нибудь есть, ещё что-то, в общем всё, что может подтвердить Ваши слова об отгрузке, также и по выполнению услуг доказательства нужны, непосредственно по обстоятельствам уже подумайте, что можно использовать.