В соответствии с п. 1 ст. 27 ГК РФ
Несовершеннолетний, достигший шестнадцати лет, может быть объявлен полностью дееспособным, если он работает по трудовому договору, в том числе по контракту, или с согласия родителей, усыновителей или попечителя занимается предпринимательской деятельностью.
Объявление несовершеннолетнего полностью дееспособным (эмансипация) производится по решению органа опеки и попечительства — с согласия обоих родителей, усыновителей или попечителя либо при отсутствии такого согласия — по решению суда.
Для регистрации несовершеннолетнего, достигшего возраста 16 лет, в качестве ИП возможна только с согласия родителей. Если согласие дает только один родитель, а связи со вторым родителем отсутствует, т.е. он бездействует, можно пробовать получить согласие на эмансипацию от органов опеки. Если будет получен отказ — признавать эмансипацию в судебном порядке.
Только после признания эмансипации уже регистрироваться в качестве ИП. В этом случае при предоставлении в ИФНС наряду с документами для регистрации в качестве ИП решения от органа опеки или суда о признании заявителя эмансипированным согласие родителей предоставлять уже не надо.